Protein–RNA interactions for Protein: Q15366

PCBP2, Poly(rC)-binding protein 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP2Q15366 IPO4-203ENST00000558046 3440 ntTSL 211.62□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-207ENST00000558780 3540 ntTSL 211.61□□□□□ -0.553e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-211ENST00000560155 3485 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.593e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-214ENST00000560798 3581 ntTSL 211.35□□□□□ -0.593e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-217ENST00000561090 3632 ntTSL 210.91□□□□□ -0.663e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-201ENST00000354464 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.743e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 IPO4-209ENST00000559588 3537 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.83e-6■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.243e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD1-205ENST00000440204 646 ntTSL 412.19□□□□□ -0.468e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.48e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD1-216ENST00000498278 996 ntTSL 55.8□□□□□ -1.488e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.648e-9■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 MBNL2-206ENST00000469707 2574 ntTSL 1 (best)7.68□□□□□ -1.189e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.429e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.479e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.519e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.529e-8■■■□□ 17.2
PCBP2Q15366 CELF1-203ENST00000361904 1580 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.812e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CELF1-205ENST00000395292 2191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.992e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CELF1-202ENST00000358597 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.21□□□□□ -1.12e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.062e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CERS2-206ENST00000421609 738 ntTSL 323.77■■□□□ 1.44e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.32e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PTPN18-213ENST00000489215 460 ntTSL 422.6■■□□□ 1.212e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.152e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PPP1R37-206ENST00000544069 712 ntTSL 522.02■■□□□ 1.122e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 ADGRA3-208ENST00000506346 453 ntTSL 321.89■■□□□ 1.092e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PSMD3-202ENST00000415039 1598 ntTSL 221.48■■□□□ 1.032e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PTPN18-205ENST00000428843 785 ntTSL 321.36■■□□□ 1.012e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.92e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.882e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 MTA2-206ENST00000531261 563 ntTSL 420.47■□□□□ 0.872e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.852e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.852e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 ACTB-203ENST00000417101 472 ntTSL 420.09■□□□□ 0.811e-12■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.82e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.792e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IFNGR2-205ENST00000439213 906 ntTSL 519.98■□□□□ 0.792e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TKFC-210ENST00000529479 1781 ntTSL 1 (best)19.71■□□□□ 0.751e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.72e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.692e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.671e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.542e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.442e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.413e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-204ENST00000587096 1065 ntTSL 517.48■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.363e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-209ENST00000587985 1754 ntTSL 517.27■□□□□ 0.352e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NPDC1-205ENST00000488145 701 ntTSL 217.17■□□□□ 0.342e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 IFNGR2-206ENST00000545369 966 ntTSL 517■□□□□ 0.312e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 EME2-206ENST00000570069 5613 ntTSL 216.81■□□□□ 0.282e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-211ENST00000590216 789 ntTSL 516.79■□□□□ 0.282e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.277e-8■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-205ENST00000587406 1923 ntTSL 516.47■□□□□ 0.232e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.222e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.212e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-210ENST00000589448 1799 ntTSL 516.33■□□□□ 0.22e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 NPDC1-204ENST00000485589 506 ntTSL 216.2■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PPP1R37-203ENST00000496125 555 ntTSL 316.17■□□□□ 0.182e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-204ENST00000559238 1341 ntTSL 515.74■□□□□ 0.112e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 MICAL3-205ENST00000424046 542 ntTSL 415.61■□□□□ 0.092e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PSMD3-204ENST00000540504 458 ntTSL 315.47■□□□□ 0.072e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-205ENST00000559310 792 ntTSL 1 (best)15.26■□□□□ 0.032e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.022e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-228ENST00000618469 718 ntTSL 1 (best)15.04■□□□□ -02e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PKP4-214ENST00000492496 796 ntTSL 315.04■□□□□ -02e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-207ENST00000560301 987 ntTSL 1 (best)14.86□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.032e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-207ENST00000587915 540 ntTSL 414.84□□□□□ -0.032e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-207ENST00000589152 3365 ntTSL 214.33□□□□□ -0.112e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-206ENST00000586358 770 ntTSL 514.17□□□□□ -0.142e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.162e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-223ENST00000494123 1612 ntTSL 1 (best)14.01□□□□□ -0.172e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 EME2-202ENST00000561903 4586 ntTSL 213.95□□□□□ -0.182e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PTPN18-204ENST00000420717 599 ntTSL 313.77□□□□□ -0.212e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-209ENST00000470026 2108 ntTSL 1 (best)13.5□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BCL2L2-203ENST00000554635 545 ntTSL 1 (best)13.49□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 BRCA1-218ENST00000489037 455 ntTSL 413.48□□□□□ -0.252e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-203ENST00000586357 482 ntTSL 413.44□□□□□ -0.262e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-215ENST00000608689 969 ntTSL 513.36□□□□□ -0.273e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 CHEK2-210ENST00000416671 2560 ntTSL 1 (best)13.31□□□□□ -0.282e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-203ENST00000585748 746 ntTSL 313.24□□□□□ -0.292e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-208ENST00000560645 903 ntTSL 1 (best)13.17□□□□□ -0.32e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-209ENST00000593219 637 ntTSL 312.94□□□□□ -0.342e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.351e-10■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-217ENST00000609257 956 ntTSL 512.73□□□□□ -0.373e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC12.67□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 STK11-204ENST00000585851 505 ntTSL 312.67□□□□□ -0.382e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 DNAJC17-206ENST00000560065 704 ntTSL 512.28□□□□□ -0.442e-7■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-215ENST00000592369 528 ntTSL 312.25□□□□□ -0.452e-6■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 PLCG1-219ENST00000612731 544 ntTSL 312.21□□□□□ -0.453e-19■■■□□ 17.1
PCBP2Q15366 TMEM161A-214ENST00000592147 347 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 17.1
Retrieved 100 of 29,421 protein–RNA pairs in 231.8 ms