Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 OPRL1-201ENST00000336866 3321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
BNIP1Q12981 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ATP2C1-214ENST00000508532 4969 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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BNIP1Q12981 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
BNIP1Q12981 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
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