Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
ITIH3Q06033 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms