Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.02■□□□□ -0
TNFRSF17Q02223 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TNFRSF17Q02223 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms