Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GJA4P35212 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GJA4P35212 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms