Protein–RNA interactions for Protein: P12259

F5, Coagulation factor V, humanhuman

Predictions only

Length 2,224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F5P12259 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
F5P12259 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
F5P12259 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
F5P12259 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
F5P12259 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms