Protein–RNA interactions for Protein: P0CG40

SP9, Transcription factor Sp9, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP9P0CG40 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC021723.1-201ENST00000486306 515 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SP9P0CG40 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms