Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 BCAN-201ENST00000329117 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 NRIP3-201ENST00000309166 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RUNX3-203ENST00000399916 4340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 STK3-201ENST00000419617 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EBAG9O00559 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms