Protein–RNA interactions for Protein: A4GXA9

EME2, Probable crossover junction endonuclease EME2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME2A4GXA9 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
EME2A4GXA9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms