Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC1

JADE2, E3 ubiquitin-protein ligase Jade-2, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JADE2Q9NQC1 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
JADE2Q9NQC1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms