Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CLMPQ9H6B4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CLMPQ9H6B4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms