Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J1

B3GNT4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3GNT4Q9C0J1 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
B3GNT4Q9C0J1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B3GNT4Q9C0J1 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B3GNT4Q9C0J1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B3GNT4Q9C0J1 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B3GNT4Q9C0J1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B3GNT4Q9C0J1 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
B3GNT4Q9C0J1 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms