Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
BCO2Q9BYV7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms