Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNRD1-204ENST00000376785 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC011239.1-201ENST00000430988 584 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AP001043.1-206ENST00000613045 730 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
KRTAP2-4Q9BYR9 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms