Protein–RNA interactions for Protein: Q9BS92

NIPSNAP3B, Protein NipSnap homolog 3B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 COL8A2-201ENST00000303143 4447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NIPSNAP3BQ9BS92 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms