Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
EBF4Q9BQW3 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EBF4Q9BQW3 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms