Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPIP5K1-209ENST00000420765 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PSD-202ENST00000406432 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TRPA1-201ENST00000262209 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 LMBRD2-201ENST00000296603 8185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 GORASP1-201ENST00000319283 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 PPFIA4-204ENST00000447715 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
PMCHL2Q9BQD1 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PMCHL2Q9BQD1 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms