Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CAVIN3Q969G5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CAVIN3Q969G5 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms