Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWX9

SELENOM, Selenoprotein M, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOMQ8WWX9 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SELENOMQ8WWX9 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SELENOMQ8WWX9 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms