Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SUSD1Q6UWL2 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SUSD1Q6UWL2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms