Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV97

PERM1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PERM1Q5SV97 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PERM1Q5SV97 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms