Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
ALFQ53S48 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ALFQ53S48 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms