Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
ZNF239Q16600 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
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ZNF239Q16600 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNF239Q16600 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNF239Q16600 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ZNF239Q16600 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ZNF239Q16600 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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