Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SIX1Q15475 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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SIX1Q15475 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SIX1Q15475 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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