Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CUL4AQ13619 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms