Protein–RNA interactions for Protein: Q13404

UBE2V1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2V1Q13404 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SIAE-201ENST00000263593 5583 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PAX8-204ENST00000397647 3633 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RHOH-217ENST00000610353 2268 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 VCP-201ENST00000358901 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BCAM-211ENST00000611077 3430 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SYT1-204ENST00000457153 4592 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DCAF12L1-201ENST00000371126 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 NFKBIZ-202ENST00000326172 3923 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ILDR1-201ENST00000273691 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PLA2G6-202ENST00000335539 3060 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 UAP1L1-201ENST00000360271 3201 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ANKRD49-210ENST00000544612 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC026992.2-203ENST00000563004 2419 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SLC26A6-205ENST00000395550 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 ADAM32-206ENST00000519315 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 GOSR2-235ENST00000640269 2190 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 EWSAT1-201ENST00000415504 2214 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 DQX1-202ENST00000404568 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 HIPK1-205ENST00000369558 8157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
UBE2V1Q13404 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms