Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.316e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.176e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ERGIC3-207ENST00000438317 590 ntTSL 312.14□□□□□ -0.471e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-210ENST00000563221 532 ntTSL 29.5□□□□□ -0.896e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-219ENST00000568672 523 ntTSL 29.5□□□□□ -0.896e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-207ENST00000562428 473 ntTSL 56.89□□□□□ -1.316e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAE1-216ENST00000566663 576 ntTSL 36.15□□□□□ -1.426e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NSUN2-208ENST00000513888 1290 ntTSL 218.47■□□□□ 0.558e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TCF3-211ENST00000587425 629 ntTSL 218.59■□□□□ 0.577e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 EFTUD2-201ENST00000402521 3045 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.822e-10■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.715e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SSR3-205ENST00000467789 1039 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.46e-9■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SSR3-206ENST00000476217 807 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.36e-9■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDCA8-201ENST00000327331 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.342e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CDCA8-202ENST00000373055 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.722e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-214ENST00000548273 818 ntTSL 315.82■□□□□ 0.127e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-217ENST00000549988 544 ntTSL 314.68□□□□□ -0.067e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.386e-14■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-215ENST00000549479 573 ntTSL 212.61□□□□□ -0.397e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-209ENST00000547704 760 ntTSL 512.27□□□□□ -0.457e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-221ENST00000551600 786 ntTSL 512.27□□□□□ -0.457e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-207ENST00000547479 623 ntTSL 511.74□□□□□ -0.537e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-219ENST00000551500 552 ntTSL 1 (best)6.81□□□□□ -1.327e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NAP1L1-218ENST00000550934 851 ntTSL 56□□□□□ -1.457e-43■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.851e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MYDGF-202ENST00000596031 335 ntTSL 317.67■□□□□ 0.421e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.766e-9■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CMAS-202ENST00000534981 1575 ntTSL 1 (best)22.9■■□□□ 1.266e-9■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-227ENST00000581858 644 ntTSL 519.07■□□□□ 0.649e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-216ENST00000577398 926 ntTSL 219.07■□□□□ 0.649e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.469e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.189e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-220ENST00000578101 4148 ntTSL 212.24□□□□□ -0.459e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-222ENST00000579294 3936 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.489e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FLII-215ENST00000545457 3975 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.639e-8■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 USP9X-201ENST00000324545 12401 ntTSL 5 BASIC8.06□□□□□ -1.121e-7■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.144e-24■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.584e-24■□□□□ 10.8
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PABPC4Q13310 RAN-211ENST00000541679 572 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-24■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RAN-203ENST00000448750 2455 ntTSL 27.97□□□□□ -1.134e-24■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ERGIC3-215ENST00000486268 584 ntTSL 213.17□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 10.8
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PABPC4Q13310 ERGIC3-204ENST00000411577 601 ntTSL 211.01□□□□□ -0.651e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CTDNEP1-209ENST00000574205 1506 ntTSL 539.04■■■■□ 3.846e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FBXW5-202ENST00000428398 718 ntTSL 533.28■■■□□ 2.925e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.786e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FBXW5-203ENST00000443788 839 ntTSL 232.01■■■□□ 2.715e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.656e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.656e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.575e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.395e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.25e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PITX1-206ENST00000507253 587 ntTSL 328.37■■■□□ 2.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.115e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PITX1-202ENST00000502676 666 ntTSL 327.84■■■□□ 2.055e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.035e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.945e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-210ENST00000447144 1664 ntTSL 226.52■■□□□ 1.846e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NDUFS3-210ENST00000533105 567 ntTSL 426.43■■□□□ 1.825e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-206ENST00000398085 796 ntTSL 326.41■■□□□ 1.825e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 OXLD1-204ENST00000571757 923 ntTSL 226.27■■□□□ 1.85e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.775e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.766e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.765e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.736e-16■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-209ENST00000567868 1628 ntTSL 325.85■■□□□ 1.735e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-224ENST00000624247 1263 ntTSL 525.65■■□□□ 1.75e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CYTH2-202ENST00000391881 1546 ntTSL 525.23■■□□□ 1.635e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.596e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ROCK2-201ENST00000261535 1795 ntTSL 524.82■■□□□ 1.565e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-206ENST00000564709 2316 ntTSL 224.68■■□□□ 1.545e-6■□□□□ 10.8
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PABPC4Q13310 FBXW5-208ENST00000491246 785 ntTSL 524.4■■□□□ 1.55e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 OXLD1-202ENST00000571092 553 ntTSL 224.27■■□□□ 1.485e-6■□□□□ 10.8
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PABPC4Q13310 OXLD1-207ENST00000575992 821 ntTSL 223.8■■□□□ 1.45e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.385e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.335e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.335e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-215ENST00000476313 1704 ntTSL 323.36■■□□□ 1.335e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-211ENST00000569380 1781 ntTSL 223.35■■□□□ 1.335e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-212ENST00000470029 583 ntTSL 323.28■■□□□ 1.325e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.275e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.265e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.225e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 TNIP2-204ENST00000505186 980 ntTSL 322.55■■□□□ 1.25e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.25e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.195e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.146e-11■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-204ENST00000563741 1746 ntTSL 522.1■■□□□ 1.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 FBXW5-205ENST00000480818 1442 ntTSL 522.09■■□□□ 1.135e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 PDXK-218ENST00000498040 888 ntTSL 521.98■■□□□ 1.115e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.115e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 CIC-209ENST00000576505 1304 ntTSL 321.66■■□□□ 1.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.065e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.035e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 MBD6-204ENST00000547545 1884 ntTSL 1 (best)20.99■□□□□ 0.955e-6■□□□□ 10.8
PABPC4Q13310 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.935e-6■□□□□ 10.8
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