RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000507253.5

PITX1-206, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

TSL 3

Gene PITX1, Length 587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-206ENST00000507253 NISCHQ9Y2I1 1504 aa57.72■■■■■ 6.83
PITX1-206ENST00000507253 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa51.52■■■■■ 5.84
PITX1-206ENST00000507253 ABCC9O60706 1549 aa50.42■■■■■ 5.66
PITX1-206ENST00000507253 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa48.54■■■■■ 5.36
PITX1-206ENST00000507253 NACADO15069 1562 aa48.43■■■■■ 5.34
PITX1-206ENST00000507253 DCAF8L2P0C7V8 631 aa48.21■■■■■ 5.31
PITX1-206ENST00000507253 MYO15BQ96JP2 1530 aa48.09■■■■■ 5.29
PITX1-206ENST00000507253 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP48.07■■■■■ 5.29
PITX1-206ENST00000507253 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa47.81■■■■■ 5.24
PITX1-206ENST00000507253 UNC13AQ9UPW8 1703 aa47.4■■■■■ 5.18
PITX1-206ENST00000507253 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP47.01■■■■■ 5.12
PITX1-206ENST00000507253 BICRAQ9NZM4 1560 aa46.98■■■■■ 5.11
PITX1-206ENST00000507253 SCRIBQ14160 1630 aa46.9■■■■■ 5.1
PITX1-206ENST00000507253 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa46.63■■■■■ 5.05
PITX1-206ENST00000507253 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.29■■■■■ 5
PITX1-206ENST00000507253 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP45.8■■■■■ 4.92
PITX1-206ENST00000507253 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa45.65■■■■■ 4.9
PITX1-206ENST00000507253 CECR2Q9BXF3 1484 aa45.36■■■■■ 4.85
PITX1-206ENST00000507253 SMARCA4P51532 1647 aa44.86■■■■■ 4.77
PITX1-206ENST00000507253 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP44.81■■■■■ 4.76
PITX1-206ENST00000507253 SMARCA2P51531 1590 aa44.64■■■■■ 4.74
PITX1-206ENST00000507253 NCAPD3P42695 1498 aa44.63■■■■■ 4.73
PITX1-206ENST00000507253 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa44.61■■■■■ 4.73
PITX1-206ENST00000507253 HMGXB3Q12766 1538 aa44.46■■■■■ 4.71
PITX1-206ENST00000507253 MROH2BQ7Z745 1585 aa44.44■■■■■ 4.71
PITX1-206ENST00000507253 PEG3Q9GZU2 1588 aa44.43■■■■■ 4.7
PITX1-206ENST00000507253 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP44.28■■■■■ 4.68
PITX1-206ENST00000507253 WIZO95785 1651 aa43.98■■■■■ 4.63
PITX1-206ENST00000507253 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP43.87■■■■■ 4.61
PITX1-206ENST00000507253 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP43.56■■■■■ 4.56
PITX1-206ENST00000507253 ERCC6Q03468 1493 aa43.56■■■■■ 4.56
PITX1-206ENST00000507253 NESP48681 1621 aa43.55■■■■■ 4.56
PITX1-206ENST00000507253 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa43.55■■■■■ 4.56
PITX1-206ENST00000507253 CADPSQ9ULU8 1353 aa43.31■■■■■ 4.52
PITX1-206ENST00000507253 PDS5BQ9NTI5 1447 aa43.24■■■■■ 4.51
PITX1-206ENST00000507253 CUX2O14529 1486 aa43.18■■■■■ 4.5
PITX1-206ENST00000507253 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa43.13■■■■■ 4.49
PITX1-206ENST00000507253 CFTRP13569 1480 aa43.03■■■■■ 4.48
PITX1-206ENST00000507253 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP43.03■■■■■ 4.48
PITX1-206ENST00000507253 CCDC88BA6NC98 1476 aa42.97■■■■■ 4.47
PITX1-206ENST00000507253 CEP164Q9UPV0 1460 aa42.84■■■■■ 4.45
PITX1-206ENST00000507253 FANCD2Q9BXW9 1451 aa42.83■■■■■ 4.45
PITX1-206ENST00000507253 PRDM2Q13029 1718 aa42.83■■■■■ 4.45
PITX1-206ENST00000507253 MRC2Q9UBG0 1479 aa42.8■■■■■ 4.44
PITX1-206ENST00000507253 WDR62O43379 1518 aa42.66■■■■■ 4.42
PITX1-206ENST00000507253 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
PITX1-206ENST00000507253 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
PITX1-206ENST00000507253 ABCC8Q09428 1581 aa42.19■■■■■ 4.34
PITX1-206ENST00000507253 TOPBP1Q92547 1522 aa42.13■■■■■ 4.33
PITX1-206ENST00000507253 DNMBPQ6XZF7 1577 aa42.11■■■■■ 4.33
PITX1-206ENST00000507253 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa41.94■■■■■ 4.3
PITX1-206ENST00000507253 IFT140Q96RY7 1462 aa41.93■■■■■ 4.3
PITX1-206ENST00000507253 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP41.75■■■■■ 4.27
PITX1-206ENST00000507253 CUX1P39880 1505 aa41.73■■■■■ 4.27
PITX1-206ENST00000507253 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.26
PITX1-206ENST00000507253 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP41.68■■■■■ 4.26
PITX1-206ENST00000507253 FGD5Q6ZNL6 1462 aa41.63■■■■■ 4.25
PITX1-206ENST00000507253 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP41.6■■■■■ 4.25
PITX1-206ENST00000507253 SOGA1O94964 1423 aa41.56■■■■■ 4.24
PITX1-206ENST00000507253 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa41.52■■■■■ 4.24
PITX1-206ENST00000507253 WDR97A6NE52 1622 aa41.47■■■■■ 4.23
PITX1-206ENST00000507253 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP41.42■■■■■ 4.22
PITX1-206ENST00000507253 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP41.41■■■■■ 4.229e-14■■■■□ 25.7
PITX1-206ENST00000507253 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa41.39■■■■■ 4.22
PITX1-206ENST00000507253 TOP2BQ02880 1626 aa41.37■■■■■ 4.21
PITX1-206ENST00000507253 SYNJ1O43426 1573 aa41.31■■■■■ 4.2
PITX1-206ENST00000507253 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP41.31■■■■■ 4.2
PITX1-206ENST00000507253 OSCARQ8IYS5 282 aa41.27■■■■■ 4.2
PITX1-206ENST00000507253 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa41.23■■■■■ 4.19
PITX1-206ENST00000507253 GRIN2BQ13224 1484 aa41.15■■■■■ 4.18
PITX1-206ENST00000507253 CHD1O14646 1710 aa41.12■■■■■ 4.17
PITX1-206ENST00000507253 GAPVD1Q14C86 1478 aa41.11■■■■■ 4.17
PITX1-206ENST00000507253 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa41.11■■■■■ 4.17
PITX1-206ENST00000507253 PBRM1Q86U86 1689 aa41.1■■■■■ 4.17
PITX1-206ENST00000507253 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa41.09■■■■■ 4.17
PITX1-206ENST00000507253 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP41.09■■■■■ 4.17
PITX1-206ENST00000507253 FBLN2P98095 1184 aa40.97■■■■■ 4.15
PITX1-206ENST00000507253 SYNJ2O15056 1496 aa40.9■■■■■ 4.14
PITX1-206ENST00000507253 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
PITX1-206ENST00000507253 ERICH3Q5RHP9 1530 aa40.77■■■■■ 4.12
PITX1-206ENST00000507253 ADAMTS12P58397 1594 aa40.74■■■■■ 4.11
PITX1-206ENST00000507253 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
PITX1-206ENST00000507253 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
PITX1-206ENST00000507253 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa40.67■■■■■ 4.1
PITX1-206ENST00000507253 CLASP1Q7Z460 1538 aa40.65■■■■■ 4.1
PITX1-206ENST00000507253 ARHGEF11O15085 1522 aa40.64■■■■■ 4.1
PITX1-206ENST00000507253 FHAD1B1AJZ9 1412 aa40.64■■■■■ 4.1
PITX1-206ENST00000507253 GRIN2AQ12879 1464 aa40.61■■■■■ 4.09
PITX1-206ENST00000507253 KIF27Q86VH2 1401 aa40.59■■■■■ 4.09
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PITX1-206ENST00000507253 NUP160Q12769 1436 aa40.42■■■■■ 4.06
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PITX1-206ENST00000507253 CEP170Q5SW79 1584 aa40.4■■■■■ 4.06
PITX1-206ENST00000507253 IGF1RP08069 1367 aa40.35■■■■■ 4.05
PITX1-206ENST00000507253 ARAP1Q96P48 1450 aa40.28■■■■■ 4.04
PITX1-206ENST00000507253 CYB5RLQ6IPT4 315 aa40.2■■■■■ 4.03
PITX1-206ENST00000507253 SHROOM2Q13796 1616 aa40.17■■■■■ 4.02
PITX1-206ENST00000507253 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa40.15■■■■■ 4.02
PITX1-206ENST00000507253 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa40.14■■■■■ 4.02
PITX1-206ENST00000507253 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa40.01■■■■□ 3.99
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