Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
IFFO1Q0D2I5 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
IFFO1Q0D2I5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms