Protein–RNA interactions for Protein: Q04771

ACVR1, Activin receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACVR1Q04771 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ACVR1Q04771 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACVR1Q04771 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms