Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
NESP48681 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NESP48681 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NESP48681 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 NAGK-204ENST00000443872 878 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NESP48681 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
NESP48681 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NESP48681 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NESP48681 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NESP48681 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
NESP48681 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NESP48681 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms