Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CPS1P31327 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CPS1P31327 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ASNA1-201ENST00000357332 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CPS1P31327 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms