Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NIPSNAP2O75323 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NIPSNAP2O75323 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.7 ms