Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGA2-204ENST00000403681 4473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC3-AS1-201ENST00000499499 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
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