Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CPED1A4D0V7 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms