Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN6Q9Y6Q1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN6Q9Y6Q1 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN6Q9Y6Q1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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