Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6J3

SMAD5-AS1, SMAD5 antisense gene protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SMAD5-AS1Q9Y6J3 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms