Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6H5

SNCAIP, Synphilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCAIPQ9Y6H5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNCAIPQ9Y6H5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SNCAIPQ9Y6H5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.53■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SNCAIPQ9Y6H5 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SNCAIPQ9Y6H5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms