Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6G3

MRPL42, 39S ribosomal protein L42, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL42Q9Y6G3 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL42Q9Y6G3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL42Q9Y6G3 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MRPL42Q9Y6G3 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MRPL42Q9Y6G3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MRPL42Q9Y6G3 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MRPL42Q9Y6G3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.7 ms