Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P3

RAI2, Retinoic acid-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI2Q9Y5P3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RAI2Q9Y5P3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAI2Q9Y5P3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAI2Q9Y5P3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms