Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SRPRBQ9Y5M8 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SRPRBQ9Y5M8 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SRPRBQ9Y5M8 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms