Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E9

PCDHB14, Protocadherin beta-14, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB14Q9Y5E9 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCDHB14Q9Y5E9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCDHB14Q9Y5E9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCDHB14Q9Y5E9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms