Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y548

YIPF1, Protein YIPF1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF1Q9Y548 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
YIPF1Q9Y548 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
YIPF1Q9Y548 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
YIPF1Q9Y548 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms