Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4W6

AFG3L2, AFG3-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFG3L2Q9Y4W6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AFG3L2Q9Y4W6 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
AFG3L2Q9Y4W6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
AFG3L2Q9Y4W6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AFG3L2Q9Y4W6 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms