Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRAF6Q9Y4K3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRAF6Q9Y4K3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms