Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HCN4Q9Y3Q4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HCN4Q9Y3Q4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms