Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
YBX2Q9Y2T7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
YBX2Q9Y2T7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
YBX2Q9Y2T7 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
YBX2Q9Y2T7 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms