Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K7

KDM2A, Lysine-specific demethylase 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM2AQ9Y2K7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.77■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
KDM2AQ9Y2K7 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
KDM2AQ9Y2K7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.65■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KDM2AQ9Y2K7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
KDM2AQ9Y2K7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms