Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3BQ9Y2G0 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3BQ9Y2G0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3BQ9Y2G0 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3BQ9Y2G0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3BQ9Y2G0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EFR3BQ9Y2G0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3BQ9Y2G0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms