Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y289

SLC5A6, Sodium-dependent multivitamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A6Q9Y289 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC5A6Q9Y289 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SLC5A6Q9Y289 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms